Depende completamente de lo que quieras hacer. CS y EE son carreras muy diferentes. CS dedica significativamente más tiempo a la programación, los algoritmos, los sistemas operativos, todo lo relacionado con la creación de un programa eficiente y la solución de problemas al usar dichos programas.
EE, si bien es probable que te introduzcan en algunos temas informáticos, difícilmente tratará estos temas a menos que se tomen como optativas. Si está interesado en computadoras, es mucho más probable que EE se centre en hardware y circuitos analógicos. EE todavía utilizará la programación, pero no hay tanto énfasis como en una CS importante.
Observaré que la CPRE tiende a ser un buen punto medio entre los dos. Este es el mayor que elegiría si tuviera que decidir entre los dos. CPRE obtendrá varios cursos de EE y cursos electivos, a la vez que adquirirá más conocimientos sobre la programación. Actualmente soy un estudiante de último año en CPRE, y el plan de estudios es básicamente lo más intermedio posible. Sin embargo, si tuviera que elegir, diría EE, ya que disfruto de la física, las matemáticas y el diseño mucho más que la programación, las estructuras de datos y los algoritmos.
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