Yo sugeriría aprender mecánica primero.
E&M es para la mayoría de las personas, y para mí personalmente, un poco más difícil que la mecánica. La razón es que la mecánica es más fácil de identificar: podemos visualizar una oscilación del péndulo, un resorte que sube y baja y un bloque cae por una rampa. Al menos tenemos una idea intuitiva de lo que está por suceder. Sin embargo, en E&M este no es siempre el caso: no puede visualizar qué tan rápido se mueven los electrones en un cable; ni siquiera se puede tener una idea intuitiva de lo que realmente significa y se siente la fuerza del campo electrónico. Es decir, E&M es más abstracto.
Aunque ambos requieren el uso del cálculo, en mi opinión, el cálculo para E&M es considerablemente más difícil que el cálculo para la mecánica. Creo que la habilidad más probada de cálculo en mecánica es calcular derivadas de ciertas funciones (desplazamiento, velocidad, trabajo, etc.), mientras que en E&M se requiere mucho más. La integración se usa mucho más a menudo: encontrar la carga total al integrar la densidad de carga lineal, por ejemplo.
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Así que es una buena idea comenzar primero con Mecánica y luego llegar a E&M. Tienes la sensación de usar el cálculo para resolver problemas antes de sumergirte en problemas más difíciles.