Trabajo con un par de personas que tomaron clases de ML en universidades portuguesas y están muy bien informados. No espero que las universidades españolas sean de un nivel inferior.
En lo que se refiere a la investigación, eso depende de lo que consideres que es una investigación de alto nivel. Si tomas un vagón de aprendizaje profundo, entonces estarás limitado a tal vez unas cuantas universidades del mundo, si es que muchas. Sin embargo, se está haciendo mucha investigación, tanto en entornos corporativos como en universidades.
Dicho esto, no sé cómo se ubican las universidades en términos de investigación de vanguardia en LD, ya que puede ser muchas cosas. Sin embargo, si la investigación de EM es de su interés, debe hablar con los departamentos de las universidades para averiguar en qué están trabajando. Puede ser lo que consideres una investigación de alto nivel o no, y podría ser interesante para ti o no.
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Sin embargo no creo que el país sea lo que separa a las universidades. Son sus programas, fondos y profesores. Hablar con ellos puede ser tu mejor curso de acción.