Nota: Esta es solo mi opinión.
En primer lugar, creo que no deberías preocuparte por cosas así. Ayuda a tu hermana a recuperarse y asegúrate de que está bien. La familia es lo primero, especialmente cuando tú, tu hermana y tu familia pasaron por una experiencia tan horrible.
Dicho esto (probablemente me llamarán monstruo sin corazón), es posible que desee explicar a las universidades por qué sus calificaciones bajaron en el año junior. La forma en que haga esto depende completamente de usted (probablemente a través de una declaración personal, o algún otro equivalente). Todo esto depende de cuánto significa la universidad para usted y su familia.
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Lo más seguro es que no estoy calificado para decirte cómo manejar tu vida, pero creo que si brindas un poco de información sobre por qué tus calificaciones bajaron el segundo semestre, solo te beneficiaría. Francamente, lo retrataría como un individuo extremadamente resistente, en base a lo que dijo con respecto a sus calificaciones superiores.
Buena suerte mi amigo.
**EDITAR**
Con respecto a la solicitud a Stanford SCEA, el porcentaje de solicitantes admitidos en Stanford a través de Early Action puede ser mayor, pero debe recordar que las personas que están aplicando a través de este método son posiblemente las mejores de las mejores. El GPA y los resultados de los exámenes no lo reducirán, ya que estoy seguro de que has escuchado incesantemente en estos tiempos cambiantes. En toda mi franqueza, debes mirar otros aspectos de tu perfil antes de tomar una decisión al respecto.