Si y no
Como probablemente ya hayas dicho o descubierto, jQuery todavía es JavaScript. Entonces, enfocándote en aprender más JavaScript o jQuery, de cualquier manera, aprenderás más sobre JavaScript.
También me gustaría agregar: jQuery está en todas partes, como señaló otro comentarista, y todavía se usa ampliamente. Sin embargo, los Frameworks de JavaScript son muy populares ahora también en la industria, y los frameworks no usan jQuery. No he tocado jQuery durante los últimos 2 años como desarrollador web.
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Mi consejo es seguir aprendiendo JavaScript solo, pero también comenzar a aprender jQuery, también. jQuery hace que sea más fácil manipular cosas que puedes ver en la pantalla, como menús, controles deslizantes, animaciones complejas, etc. Pero a veces es más limpio usar JavaScript antiguo y puedes usar la funcionalidad de JavaScript normal junto con jQuery.
Mantenga la sierra afilada y no pierda el contacto con el viejo JavaScript de “vainilla”. ¡Algún día realmente podría ayudarte mucho saber cómo hacer algo solo en JavaScript! 🙂